盱眙縣物產資源極為豐富。動物資源主要有狼、獾、狐、兔、黃鼬、草獐以及171種留鳥、候鳥等野生動物，洪澤湖和淮河盛產鳊魚、鯉魚、鯽魚、銀魚、黃鱔等各種水生動物，其中鯉科魚類占60％以上。中藥材資源主要有野生藥用植物780個品種，藥用動物42個品種。蜈蚣、靈芝、黃精、貓爪草等珍稀名貴藥材，丹參、山楂、桔梗、柴胡、白頭翁等常規藥材遠銷省內外。林木資源存有樹種65科232種，其中裸子植物5科22種、被子植物60科210種。1985年林業調查，境內新發現的樹木有漆樹、毛葉歐李、迎春花、野核桃、羽葉泡花、湖北山楂、毛梾、紅脈釣樟、中華石楠等。鐵山寺森林公園內還發現有欒樹、無患子、重陽木、椴樹等稀有樹種。礦產資源：境內蘊藏著凹凸棒石黏土、玄武巖、石灰石、礦泉水、石油等多種礦產。凹凸棒石黏土發現的礦床（點）32處，其中大型礦床2處、中型礦床4處、小型礦床5處、礦點21處。查明優質資源量9646萬噸，預測有用黏土總資源量21.77億噸，占全國總量的73％。玄武巖主要分布于縣域南部丘陵低山地區，出露面積500平方千米，資源總量177億噸。按其工業用途，可用于建筑石料、巖棉、水泥、鑄石等。石灰巖資源主要分布于官灘鎮至古桑街道佛窩一帶，面積78平方千米，儲量約21.2億噸，其中用作水泥原料約1.07億噸、用作建筑石料的約2680萬噸。礦泉水主要分布縣域南部和西南部丘陵低山地區，面積1014平方千米。黃花塘鎮泥沛和桂五鎮“八四”庫礦泉水通過部級鑒定，其中泥沛礦泉水埋深80～120米、“八四”庫礦泉水埋深54.9米，水化學類型均為HCO3-Ca·Mg型水。馬壩油田已探明儲量約1000萬噸，自1995年勘探開采以來，施工53口油井。管仲、鮑集、淮河已探明有石油，2002年在管仲鎮區域施工的4口油井，有3口出油。